Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TAP1Q03518 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAP1Q03518 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms