Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB2Q03252 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms