Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF8Q02556 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms