Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC2Q02487 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC2Q02487 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms