Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SP4Q02446 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP4Q02446 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP4Q02446 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP4Q02446 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP4Q02446 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP4Q02446 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP4Q02446 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP4Q02446 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP4Q02446 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SP4Q02446 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SP4Q02446 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP4Q02446 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SP4Q02446 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP4Q02446 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP4Q02446 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SP4Q02446 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP4Q02446 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP4Q02446 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP4Q02446 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP4Q02446 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP4Q02446 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP4Q02446 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SP4Q02446 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP4Q02446 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP4Q02446 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP4Q02446 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP4Q02446 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP4Q02446 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP4Q02446 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP4Q02446 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP4Q02446 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP4Q02446 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP4Q02446 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP4Q02446 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP4Q02446 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP4Q02446 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP4Q02446 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP4Q02446 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP4Q02446 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP4Q02446 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP4Q02446 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SP4Q02446 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP4Q02446 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP4Q02446 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms