Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSG1Q02413 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms