Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCEQ02156 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCEQ02156 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms