Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRCDQ00LT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms