Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG6Q00889 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSG6Q00889 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms