Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSF1Q00613 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HSF1Q00613 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HSF1Q00613 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HSF1Q00613 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSF1Q00613 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HSF1Q00613 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSF1Q00613 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HSF1Q00613 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSF1Q00613 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSF1Q00613 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSF1Q00613 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSF1Q00613 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSF1Q00613 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HSF1Q00613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSF1Q00613 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSF1Q00613 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSF1Q00613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSF1Q00613 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSF1Q00613 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSF1Q00613 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSF1Q00613 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSF1Q00613 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSF1Q00613 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms