Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKOR1P84550 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms