Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMF1P82094 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMF1P82094 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMF1P82094 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMF1P82094 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMF1P82094 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMF1P82094 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMF1P82094 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMF1P82094 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMF1P82094 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMF1P82094 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMF1P82094 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMF1P82094 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMF1P82094 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMF1P82094 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMF1P82094 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMF1P82094 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMF1P82094 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMF1P82094 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMF1P82094 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMF1P82094 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TMF1P82094 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TMF1P82094 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TMF1P82094 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMF1P82094 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMF1P82094 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMF1P82094 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMF1P82094 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMF1P82094 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMF1P82094 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMF1P82094 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMF1P82094 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMF1P82094 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMF1P82094 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMF1P82094 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMF1P82094 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMF1P82094 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TMF1P82094 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMF1P82094 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMF1P82094 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMF1P82094 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMF1P82094 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMF1P82094 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TMF1P82094 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TMF1P82094 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMF1P82094 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMF1P82094 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMF1P82094 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMF1P82094 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMF1P82094 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMF1P82094 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMF1P82094 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMF1P82094 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMF1P82094 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms