Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX1P78414 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX1P78414 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRX1P78414 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX1P78414 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX1P78414 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX1P78414 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX1P78414 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX1P78414 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX1P78414 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX1P78414 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX1P78414 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX1P78414 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX1P78414 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX1P78414 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX1P78414 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX1P78414 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX1P78414 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX1P78414 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX1P78414 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX1P78414 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX1P78414 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX1P78414 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX1P78414 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms