Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC5P78333 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPC5P78333 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC5P78333 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC5P78333 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC5P78333 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC5P78333 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC5P78333 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC5P78333 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC5P78333 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC5P78333 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC5P78333 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC5P78333 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC5P78333 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC5P78333 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC5P78333 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC5P78333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC5P78333 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC5P78333 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC5P78333 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC5P78333 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC5P78333 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC5P78333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC5P78333 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC5P78333 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC5P78333 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC5P78333 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC5P78333 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC5P78333 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC5P78333 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC5P78333 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC5P78333 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC5P78333 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC5P78333 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC5P78333 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC5P78333 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC5P78333 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC5P78333 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC5P78333 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC5P78333 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC5P78333 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC5P78333 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC5P78333 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC5P78333 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC5P78333 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC5P78333 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC5P78333 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC5P78333 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC5P78333 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC5P78333 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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