Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2P78314 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms