Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P63124 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERV-K104P63124 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms