Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRA2BP62995 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms