Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL30P62888 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL30P62888 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL30P62888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL30P62888 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL30P62888 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL30P62888 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL30P62888 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL30P62888 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL30P62888 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms