Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD3P62318 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms