Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPS29P62273 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RPS29P62273 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RPS29P62273 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RPS29P62273 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPS29P62273 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPS29P62273 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RPS29P62273 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPS29P62273 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPS29P62273 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPS29P62273 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPS29P62273 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPS29P62273 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPS29P62273 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPS29P62273 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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