Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTBP60709 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTBP60709 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTBP60709 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTBP60709 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTBP60709 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTBP60709 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTBP60709 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTBP60709 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTBP60709 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTBP60709 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTBP60709 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms