Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVPABLB-1P60509 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms