Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00315P59091 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms