Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB4P54760 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB4P54760 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB4P54760 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms