Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRISP1P54107 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms