Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2KP53803 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.4 ms