Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPAP53621 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPAP53621 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COPAP53621 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPAP53621 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPAP53621 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPAP53621 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPAP53621 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COPAP53621 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPAP53621 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPAP53621 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPAP53621 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPAP53621 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPAP53621 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPAP53621 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPAP53621 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPAP53621 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPAP53621 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPAP53621 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPAP53621 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPAP53621 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPAP53621 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPAP53621 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPAP53621 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPAP53621 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPAP53621 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPAP53621 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPAP53621 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPAP53621 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPAP53621 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPAP53621 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPAP53621 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPAP53621 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPAP53621 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPAP53621 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPAP53621 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPAP53621 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPAP53621 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPAP53621 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPAP53621 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPAP53621 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPAP53621 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPAP53621 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPAP53621 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPAP53621 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPAP53621 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPAP53621 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPAP53621 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPAP53621 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms