Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTBP53611 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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