Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF135P52742 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF135P52742 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF135P52742 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF135P52742 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF135P52742 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF135P52742 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF135P52742 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF135P52742 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms