Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR8P51685 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR8P51685 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR8P51685 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR8P51685 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR8P51685 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR8P51685 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR8P51685 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR8P51685 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR8P51685 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR8P51685 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR8P51685 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR8P51685 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR8P51685 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR8P51685 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR8P51685 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR8P51685 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR8P51685 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR8P51685 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR8P51685 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR8P51685 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR8P51685 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR8P51685 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR8P51685 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR8P51685 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR8P51685 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR8P51685 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR8P51685 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR8P51685 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR8P51685 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR8P51685 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCR8P51685 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCR8P51685 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR8P51685 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR8P51685 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR8P51685 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR8P51685 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR8P51685 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR8P51685 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR8P51685 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR8P51685 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR8P51685 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR8P51685 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR8P51685 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms