Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR5P51681 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR5P51681 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR5P51681 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR5P51681 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR5P51681 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR5P51681 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR5P51681 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR5P51681 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR5P51681 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR5P51681 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR5P51681 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR5P51681 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR5P51681 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR5P51681 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR5P51681 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR5P51681 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR5P51681 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR5P51681 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR5P51681 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR5P51681 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR5P51681 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR5P51681 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR5P51681 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR5P51681 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR5P51681 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR5P51681 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR5P51681 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR5P51681 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR5P51681 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR5P51681 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR5P51681 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR5P51681 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms