Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK9P50750 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK9P50750 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK9P50750 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK9P50750 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK9P50750 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK9P50750 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK9P50750 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK9P50750 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK9P50750 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK9P50750 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK9P50750 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK9P50750 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK9P50750 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK9P50750 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK9P50750 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK9P50750 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK9P50750 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK9P50750 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK9P50750 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK9P50750 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK9P50750 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK9P50750 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms