Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP153P49790 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP153P49790 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP153P49790 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP153P49790 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP153P49790 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
NUP153P49790 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NUP153P49790 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NUP153P49790 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP153P49790 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP153P49790 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP153P49790 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP153P49790 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP153P49790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP153P49790 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP153P49790 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP153P49790 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP153P49790 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP153P49790 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP153P49790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP153P49790 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP153P49790 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP153P49790 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP153P49790 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NUP153P49790 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NUP153P49790 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP153P49790 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP153P49790 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP153P49790 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP153P49790 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP153P49790 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP153P49790 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NUP153P49790 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NUP153P49790 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NUP153P49790 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUP153P49790 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUP153P49790 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUP153P49790 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NUP153P49790 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP153P49790 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP153P49790 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP153P49790 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP153P49790 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP153P49790 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP153P49790 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUP153P49790 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUP153P49790 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUP153P49790 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUP153P49790 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUP153P49790 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NUP153P49790 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NUP153P49790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUP153P49790 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUP153P49790 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUP153P49790 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUP153P49790 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUP153P49790 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NUP153P49790 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NUP153P49790 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NUP153P49790 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NUP153P49790 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NUP153P49790 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NUP153P49790 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NUP153P49790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NUP153P49790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NUP153P49790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NUP153P49790 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NUP153P49790 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NUP153P49790 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NUP153P49790 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NUP153P49790 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NUP153P49790 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NUP153P49790 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP153P49790 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP153P49790 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP153P49790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP153P49790 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP153P49790 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP153P49790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NUP153P49790 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUP153P49790 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NUP153P49790 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms