Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB2P49721 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB2P49721 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms