Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIM1P49642 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRIM1P49642 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRIM1P49642 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms