Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARS2P49590 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARS2P49590 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARS2P49590 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARS2P49590 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARS2P49590 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARS2P49590 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARS2P49590 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARS2P49590 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARS2P49590 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARS2P49590 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARS2P49590 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARS2P49590 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARS2P49590 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARS2P49590 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARS2P49590 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARS2P49590 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARS2P49590 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARS2P49590 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARS2P49590 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARS2P49590 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HARS2P49590 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARS2P49590 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARS2P49590 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARS2P49590 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARS2P49590 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARS2P49590 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARS2P49590 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARS2P49590 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARS2P49590 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARS2P49590 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARS2P49590 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARS2P49590 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARS2P49590 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARS2P49590 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARS2P49590 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARS2P49590 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARS2P49590 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARS2P49590 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARS2P49590 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARS2P49590 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARS2P49590 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARS2P49590 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARS2P49590 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARS2P49590 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARS2P49590 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARS2P49590 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HARS2P49590 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HARS2P49590 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARS2P49590 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms