Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCT3P49368 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCT3P49368 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCT3P49368 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCT3P49368 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCT3P49368 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCT3P49368 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCT3P49368 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCT3P49368 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCT3P49368 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT3P49368 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT3P49368 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT3P49368 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT3P49368 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT3P49368 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT3P49368 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT3P49368 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT3P49368 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT3P49368 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT3P49368 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT3P49368 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms