Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX1P48742 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX1P48742 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX1P48742 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX1P48742 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX1P48742 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX1P48742 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX1P48742 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX1P48742 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX1P48742 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX1P48742 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX1P48742 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX1P48742 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX1P48742 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX1P48742 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX1P48742 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX1P48742 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX1P48742 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX1P48742 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX1P48742 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX1P48742 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX1P48742 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX1P48742 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX1P48742 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX1P48742 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX1P48742 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX1P48742 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms