Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PIP4K2AP48426 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PIP4K2AP48426 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PIP4K2AP48426 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PIP4K2AP48426 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PIP4K2AP48426 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PIP4K2AP48426 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PIP4K2AP48426 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIP4K2AP48426 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIP4K2AP48426 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIP4K2AP48426 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms