Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX5P48382 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX5P48382 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX5P48382 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX5P48382 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX5P48382 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFX5P48382 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFX5P48382 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFX5P48382 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFX5P48382 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFX5P48382 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX5P48382 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX5P48382 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX5P48382 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX5P48382 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFX5P48382 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX5P48382 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX5P48382 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX5P48382 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX5P48382 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX5P48382 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX5P48382 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX5P48382 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX5P48382 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX5P48382 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX5P48382 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX5P48382 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX5P48382 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX5P48382 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFX5P48382 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX5P48382 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX5P48382 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX5P48382 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX5P48382 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX5P48382 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX5P48382 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX5P48382 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX5P48382 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX5P48382 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RFX5P48382 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX5P48382 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX5P48382 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX5P48382 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX5P48382 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX5P48382 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX5P48382 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX5P48382 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX5P48382 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX5P48382 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms