Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFX2P48378 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFX2P48378 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RFX2P48378 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFX2P48378 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFX2P48378 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFX2P48378 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFX2P48378 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RFX2P48378 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFX2P48378 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFX2P48378 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms