Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJA8P48165 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJA8P48165 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJA8P48165 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJA8P48165 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJA8P48165 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJA8P48165 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA8P48165 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJA8P48165 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJA8P48165 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA8P48165 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA8P48165 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA8P48165 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA8P48165 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA8P48165 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA8P48165 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA8P48165 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA8P48165 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms