Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A9P48067 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A9P48067 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms