Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL21P46778 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL21P46778 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL21P46778 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL21P46778 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL21P46778 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL21P46778 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL21P46778 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL21P46778 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL21P46778 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL21P46778 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL21P46778 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL21P46778 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL21P46778 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL21P46778 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL21P46778 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL21P46778 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL21P46778 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL21P46778 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL21P46778 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL21P46778 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL21P46778 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL21P46778 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL21P46778 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL21P46778 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL21P46778 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL21P46778 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL21P46778 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL21P46778 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL21P46778 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL21P46778 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL21P46778 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL21P46778 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL21P46778 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL21P46778 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL21P46778 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL21P46778 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL21P46778 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL21P46778 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL21P46778 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL21P46778 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL21P46778 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL21P46778 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms