Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC1A4P43007 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A4P43007 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms