Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A3P43003 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A3P43003 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A3P43003 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A3P43003 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A3P43003 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A3P43003 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A3P43003 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A3P43003 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A3P43003 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A3P43003 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A3P43003 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A3P43003 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A3P43003 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms