Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC1P41238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms