Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH1P40692 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH1P40692 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH1P40692 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH1P40692 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH1P40692 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH1P40692 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MLH1P40692 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH1P40692 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLH1P40692 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLH1P40692 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH1P40692 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH1P40692 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH1P40692 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH1P40692 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH1P40692 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH1P40692 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH1P40692 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH1P40692 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH1P40692 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH1P40692 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH1P40692 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH1P40692 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH1P40692 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH1P40692 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH1P40692 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH1P40692 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH1P40692 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MLH1P40692 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH1P40692 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH1P40692 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH1P40692 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH1P40692 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms