Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM23P36406 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms