Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP214P35658 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP214P35658 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP214P35658 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP214P35658 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP214P35658 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP214P35658 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP214P35658 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP214P35658 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP214P35658 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP214P35658 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP214P35658 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP214P35658 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP214P35658 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP214P35658 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP214P35658 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP214P35658 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP214P35658 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP214P35658 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP214P35658 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP214P35658 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP214P35658 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP214P35658 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP214P35658 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP214P35658 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP214P35658 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP214P35658 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP214P35658 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms